高中生名侦探工藤新一，某一天在调查事件途中，被两个身份不明的黑衣男子强灌毒药，致使身体缩小成儿时模样。为了找寻这两个黑衣男子，新一不得已化名为“江户川柯南”，生活在青梅竹马的毛利兰家中，想借助小兰的父亲毛利小五郎来找寻黑衣男子，不料毛利不但对新一找寻黑衣男子没有帮助，还是个冒失的迷糊侦探，新一实在看不过去，只好帮助毛利破了许多案子！唉！不知何时新一才能恢复原来面貌？

一副小学生的模样，一身高科技装备，一颗精明的头脑，大名鼎鼎的侦探柯南，终日与现场、凶器、怪力乱神为伍，周旋在罪犯、警察、女友之间；为解开谜底殚精竭虑，而他还是一个高中生。他和我们一起分享紧张刺激的侦破，朦胧甜蜜的感情还有智慧带来的快乐。

本碟为OVA（原创动画录映带 ）版：6贝克街的亡灵

这里正在举行，能够一举改变全世界游戏业界价值的模拟游戏“茧”的发表会，结合了最先进技术的“茧”其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过计算机的操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过事件的时代，并进行挑战的虚拟体验游戏。

柯南、小兰、灰原以及少年侦探队的成员们也接获邀请，前往参加这场受到全世界瞩目的发表会，并阴错阳差的混入政界、财经界以及演艺界等代表人物的小孩群中，趁机乘上了“茧”。另一方面，“茧”的研发者兼负责人—坚村，竟然在发表会会场遭到杀害。而在这起杀人事件发生的同时，一个自称“诺亚方舟”的人工智能闯入“茧”的计算机系统，并切断身处虚拟世界的50名孩童所有能与外界连结的管道，对现实世界中所有的招待者宣布：“在这场解决历史事件的游戏中，只要有一个人能够存活到最后就算你们赢。不过如果没有人能够存活到最后，参加游戏的所有人就会葬命于此。”开始了一场失控的游戏。少数知道柯南身份，同时也是工藤新一的父亲，世界名推理作家—工藤优作也是这场发表会的特别来宾。优作负责监修“茧”游戏中的历史事件，虽然能透过推理找出坚村遭到杀害的原因，但关于柯南一行人，他只能在控制室看着他们的表现。